Hola de nuevo, ayer tuve problemas con el servicio de foros del web y no te pude enviar la respuesta completa, la pagina a la que me refiero es la siguiente:
http://www.microsoft.com/spanish/msd...as/distapp.asp
como puedes ver es un articulo de Microsoft que habla sobre el tema, te aconsejo que leas el capitulo titulado: "Diseño de los componentes de una aplicación o servicio"
http://download.microsoft.com/downlo...Components.doc,
estoy seguro que te podra resolver tus dudas acerca de la arquitectura de aplicaciones de 3 capas en .net, el articulo completo es conocido como "la biblia de aplicaciones en 3 capas" en mi opinion es el mejor en la red sobre el tema, en fin espero que te sirva de algo