Sabes que con El Firefox he visto lo mismo mientras navego por ejemplo en esta página:
http://www.dreamwebstudios.com/
Que se ve en pantalla completa con el Iexplorer.
No sé la respuesta, pero imagino que es algo de la "medida original" o propiedades de la pelicula de flash.
Sin duda tendrás respuestas con soluciones en el foro de Flash.
Saludos.