solo verifica que lo estes agregando en la ruta correcta...por ejemplo
Código:
<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
<configuration>
<system.web>
<httpHandlers>
<add verb="GET"
path="FtbWebResource.axd"
type="FreeTextBoxControls.AssemblyResourceHandler, FreeTextBox" />
</httpHandlers>
</system.web>
</configuration>