Gracias moNTeZIon por tu comentario!!!
Pero lo que pasa es que yo estoy trabajando en una aplicacion de escritorio y no en una aplicacion web, por lo que la solucion que propones no aplicaria para este caso.
Si hay otra manera de visualizar un .swf en .Net sin necesida de un control AxShockwaveFlash y que a la vez cumpla con el requerimiento de darle transparencia al fondo, bienvenida sea la solucion, pero la verdad todavia no he encontrado nada
Espero que la solucion exista para no crearme una desilución con el .Net por lo menos en la parte multimedial.
Gracias