Puedes hacerlo de 2 formas una es así:
   Cita:  btnEscanios.Attributes.Add("onclick", "javascript:window.open('wfrmEscanios.aspx','','wi  dth=680,height=620');")
    Aunque de esa forma primero se abriría la ventana antes de que se ejecute el code que tienes server-side... y por lo tanto no tendrías las variables de la session que guardaste.. 
La otra forma sería hacer algo así:  
 Cita:   Private Sub btnEscanios_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles btnEscanios.Click
 
Session("strCircun") = cboCircun.SelectedItem.Value
Session("strTipoProcesoE") = rdbTProceso.SelectedItem.Value
...
...
Dim sbJscript As New System.Text.StringBuilder
 
        With sbJscript
            .Append("<script language=javascript> " + Chr(13))
            .Append("window.open('wfrmEscanios.aspx','','with=  680,height=620');" + Chr(13))
            .Append("</script>")
        End With
 
        Page.RegisterClientScriptBlock("Window", sbJscript.ToString())
End Sub
    Salu2