Podrías también hacer lo siguiente:
Respaldar tu información de cada base de datos exportandola a como te dicen con phpmyadmin eso lo podes hacer SIN problemas. Pero al restaurar la información, no lo vas a poder hacer con phpmyadmin si es mucha información, tendrías que hacerlo manualmente en modo consola (cmd).
Lee estos mensajes:
Que comando es? Ayuda!! Ayuda con MySQL salva bbdd de localhost
En el tercer mensaje, vas a ver otra opción respaldando las carpetas de data.