Es recomendable que use ambas formas para poder acceder al enlace en navegadores con javascript deshabilitado. Al hacer click el navegador lee antes el onclick que el href, y en el onclick anula el la acción href del link con el return false que tiene en su segunda sentencia.
Yo lo que veo es que tienes un error de sintaxis. Cambia las comillas dobles del nombre del popup miVentana por comillas simples
Código:
<tr bgcolor=#CCCC99 bordercolor=#A4A47A>
<td height="25" width="21"><font face="Verdana" size="1">
<a href="Edicion.asp?valor=editar&id=<%= objRS("id")%>" onclick="window.open(this.href, 'miVentana', 'toolbar=0,scrollbars=1,location=0,statusbar=0,menubar=1,resizable=1,screen.width,screen.height'); return false;" class="linkcell" style="text-decoration: none">
<%= objRS("id")%></a> </font></td>
</tr>
Debería de funcionarte correctamente con ese cambio
