Todo lo que pretentes hacer lo debes hacer en javascript. Tanto abrir tu ventana para llamar a tu actual script PHP que generar tu calendario como si lo deseas tomar la fecha que selecciones y dejarla tal vez en el campo del formulario de la página "padre" que la abrió ..
De hecho .. soluciones completas de este estilo de "date picker" tienes hechos muchos en javascript ..
Un ejemplo:
http://www.javascriptkit.com/script/...calendar.shtml
Un saludo,