Cita: Si esta seleccionado el Checkbox 1 y vacio el cuadro de texto y que salga un mensaje que diga DEBE COLOCAR EL NUMERO DE DOCUMENTO y haga un onFocus en el cuadro de texto..
Si te fijas .. estás mencionando un "evento" que es de "javascript" .. una "acción" que sucede en el "cliente" (en la página HTML/etc que yá generastes con PHP) .. Por ende, tu problema debes resolverlo con -javascript- no con PHP que ya perdió total control sobre lo que está sucediento en el "cliente".
Un saludo,