Tienes que ponerla en el start up, es decir ubicas un acceso directo de tu ejecutable en la carpeta de inicio del sistema ubicado en:
C:\Documents and Settings\Usuario\Menú Inicio\Programas\Inicio
Tambien puedes iniciar aplicaciones desde el Registro de Windows, Inicio/ejecutar/ escribes regedit y le das enter luego navegas hasta la clave
HKEY_LOCAL_MACHINE/Software/Microsoft/Windows/CurrentVersion/Run
Luego creas un Valor del Tipo alfanumérico le pones el nombre del programa que quieres ejecutar y seguidamente en informacion del valor le das la ruta de tu ejecutable, un Saludo!!!
