No entiendo
AGP es un tipo de conector de video, no una opción activable por software. Si tu tarjeta es AGP y esta está funcionando es que AGP está activado. Tan simple como eso.
Ahora, creo que tu pregunta va por el lado de la cantidad de aceleración de AGP (1x, 2x, 4x y 8x). El modo se debe autoseleccionar dependiendo de la combinación entre mobo y tarjeta de video. Aunque en algunos casos es necesario instalar un parche para hacerlo funcionar correctamente. Concretamente gigabyte tiene (o tuvo) ese problema, y es necesario instalar un parche para AGP que puedes bajar dentro de la sección de drivers seleccionando tu modelo particular.