Hola
HansCruz!
No sé si capté bien la idea pero mira, te pongo un ejemplo para ver si es lo que quieres, supongamos que tienes tus 2 iframes en el index, ahh pero antes la función que te va a llevar al marcador indicado:
Código:
function Ir($ruta)
{
document.getElementById("iframe2").src = $ruta;
}
Código HTML:
<iframe height="200" width="200" id="iframe1" src="ir.html"></iframe>
<iframe height="400" width="400" id="iframe2" src="ir2.html"></iframe>
En la página ir.html hay un enlace para ir a un marcador de la página ir2.html.
Código HTML:
<a href="javascript:parent.Ir('ir2.html#marca')">ir</a> Y en la página ir2.html esta el marcador.
Código HTML:
<a name="marca">aqui</a>