¿Qué sistema de ficheros utilizas en la partición raíz? Leí en Linux Magazine que Suse mejora bastante en rendimiento utilizando ext3 en la raíz en lugar de reiserfs (instalación por defecto). También puedes comprobar si tienes el DMA habilitado, y tal vez también deberías considerar la posibilidad de utilizar un escritorio más liviano como
Enlightenment o
Xfce.
Saludos.