Lo de saber cuantos click tiene cada anuncio ese sencillo cuando estas creando tu bloque de anuncio hay una seccion que dice "canales" ahi le pones un nombresito tipo "anunciohome" , "anunciobanner" etc de ahi en mas en los informes de adsense podras ver los click por cada canal.
Sobre lo que analitycs es diferente a adsense, es cierto, igualmente analitycs tiene forma de ver estadisticas para sus clientes adwords (opuesto a adsense) jeje que son los que pagan.
Pero igualmente hay un truco (que no he probado aun) que permite ver estadisticas de adsense en analitycs te dejo una de las paginas donde lo explican:
http://www.shawnhogan.com/2005/11/tr...analytics.html
y si funciona me avisas asi lo hago :) pero lo he visto comentado muchas veces y deberia funcionar bien.