1. no se si esto responde a tu pregunta o no, pero si solo deseas invocar a resizeTo, puedes hacer lo siguiente:
var st = new fx.Combo('expand', {height: true, width: true, opacity: true});
st.resizeTo(100, 0); // no hay incremento en el ancho
2. si se puede poner todo en otro fichero, si las inicializaciones necesitan realizarse una vez que cargue el documento, entonces podrias hacer esto en el otro documento
// a.js
window.onload = function () {
... inicializaciones
}
si deseas una solucion mas elaborada para añadir los eventos, entonces usa cualquiera de las funciones que te devuelve
http://www.google.com/search?q=addEvent+javascript