No entendí nada.
El cronjob lo defines en el cronjob (valga la rebundancia) .. Es el "cronjob" quien ejecutará tu script PHP indicado a en el intervalo indicado.
Observación .. el script PHP no se ejecuta así por sí sólo .. a no ser que lo hagas con las indicaciones que se describen en este tutorial:
http://www.devarticles.com/c/a/PHP/PHP-CLI-and-Cron/
Un saludo,