usa Return en tu tag <a> para realizar tu accion javascript
:
Ej:
Código:
<a href="javascript: return pregunta(1);">link</a>
<script type="text/javascript">
function pregunta(indice) {
var x=window.confirm("Está seguro de enviar este formulario?")
if (x)
document.forms[indice].submit();
return true;
} else {
return false; // Esto evita que el link "siga" su accion normal
}
}
</script>