Hola sobre lo del evento onTextChange se activa cuando pierdes el foco de la caja habiendo modificado su contenido, lo que quizas deba hacer el script de la ventana hija es indicarle que cuando sea esa caja y le asigne el dato llame a su evento change(), algo así como si fuese un boton dandole click().
y el segundo es que posiblemente estes dandole la propiedad Enabled o ReadOnly de las caja de texto y cuando se llena por medio de javascript pues es como si no hubiese tomado nada, en el !IsPostBack colocale lo siguiente a las cajas de texto
caja1.Attributes.Add("onFocus", "this.blur();");
caja2.Attributes.Add("onFocus", "this.blur();");
espero te pueda ayudar.
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