¿Tienes alguna línea con algo como lo siguiente?
AddType application/x-httpd-php .php
Se supone que con eso basta para que apache interprete los php... eso sí, una vez lo reinicies (imagino que lo hiciste, pero por si acaso)
En la guía que puse antes viene cómo se configura, pero para windows. No creo que en linux varíe la configuración del httpd.conf
