Hola destor77.
Claro que puedes usar cualquier clase para extender CodeIgniter. En tu carpeta application seguramente tienes otra llamada "libraries". Allí pon tu libreria. Luego desde el config/autoload.php puedes cargarlo desde el sector de "libraries" o desde un controlador mediante :
Código:
<?php
class MiControlador extends Controller
{
function index()
{
$this->load->library('nombre_de_la_clase');
$this->nombre_de_la_clase->algo();
}
}
?>
Una aclaración: el archivo de la libreria debe tener el mismo nombre de la clase.
Espero funcione. Hasta luego!