En primer lugar... SIEMPRE(!!!!!!!!!) tienes que tener una copia de reserva para este tipo de casos... Para esto te recomiendo pero BIEN recomendado,
Acronis True Image 10 , es un super programa.
Ahora Acronis tambien tiene un particionador y controlador de discos mejor que el Partition Magic(a mi parecer) se llama Disk Director Suite(
link directo) este link ultimo habla de un programa de recuperacion de particiones perdidas, pero no se si recupera particiones perdidas por otro software, por eso no te puedo confirmar que lo haga porque nunca probe, pero vayamos ahora mejor al problema;
en primer lugar te recomendaria ver si Partition Magic tiene alguna funcion de volver al estado anterior. Ahora no creo que se hayan borrado simplemente 30 gigas a no ser que hayas hecho lo incorrecto que es chancar una particion encima de la otra, osea poniendo una de ellas como principal al momento de unirlas.
En segundo lugar parece, segun entendi lo que escribiste, que quisiste "manualmente" copiar los archivos de una particion a otra, eso es una locura(!) por supuesto que la mitad no te iban a funcionar despues de esto...
Prueba ver que el mismo Partition Magic te lo solucione, si no creo que no habria otra solucion.