Hola, te doy la bienvenida al foro, es raro el caso que mencionas, en todo caso podrías instalar tu disco como esclavo en otra máquina y realizar un escaneo con el antivirus instalado en esa máquina.
Si deseas realizar la desinfección desde Linux puedes utilizar un antivirus para Linux, pero debido a que no uso este sistema operativo
no sabría cual recomendarte.
Saludos