Hola Xinef,
te agradezco por tu voluntad, no he podido arreglar el problema, para serte sincero no supe como asignar el content type a los links (tengo entendido que type no es una etiqueta válida para un elemento "<a>").
Anduve averiguando un poco, y otros sitios han tenido el mismo problema:
http://ostermiller.org/utils/download.html http://www.ricebridge.com/trials.htm
"Internet Explorer may want to save this jar file as a zip file. In this case, please rename it to a jar file after it has finished downloading."
Veamos que pasa, gracias nuevamente por tus respuestas.
JAC