problema al Ejectuar Aplicaciones desde Java

[Asgaroth]

Bueno ya resolvi ese problema y surgio otro, lo que pasa es que al hacer
getClass().getResource().toString();
el genera una cosa donde los espacio se reemplazan por %20
entonces ala string hay ke hacerle .repalceAll("%20", " ");
bueno y otra cosa con substring para cuando este en el jar

el nuevo problema resulta ser que, " nos e tiene acceso a la aplicacion" que esta dentro del jar
es decir, si yo digamos en el explorer de windos trato de ejecutar la aplicacion

C:/Documents and Settings/otro directorio/QuickToBot.jar!/QuickToBot/aplicacion.exe

este dice que se encuentra la ruta especificada, lo intente con

C:/Documents and Settings/otro directorio/QuickToBot.jar/QuickToBot/aplicacion.exe

y con

C:/Documents and Settings/otro directorio/QuickToBot/QuickToBot/aplicacion.exe
y tampoko funciona

hay alguna forma de accesar a esa aplicacion que esta dentro del .jar? existe algun comando especial o algo?

Gracias