Eso pasa por varios motivos. Te expongo lo que me ha sucedido ya que es algo similar.
- El explorador de windows está abierto y lo bloquea. Cerralo y trata de desconectarlo normalmente, o sea, con la opción de desconectar dispositivo.
- Cuando se hace acceso al DD externo y se guarda información, windows lo bloquea, debes darle varias veces desconectar hasta que te lo libere.
Esas son las situaciones que me han pasado y funciona.