Hola,
Para el que le interese lo único que se me ha ocurrido es hacer un ps-aux (o con los parámetros que más nos interese). Ejecuto eso desde el código java, capturo la salida y la leo mirando los procesos que se están ejecutando en ese momento.
Es algo manual y completamente dependiente del SO pero creo que funcionará sin demasiados problemas. Sigo buscando más alternativas, si encuentro algo mejor lo posteo aquí y si alguien tiene alguna sugerencia pues será bien recibida
Un saludo!
Kike.