En realidad la x está en /etc/password, en /etc/shadow se guarda la clave cifrada.
Un ejemplo de /etc/password (robado de internet, claro jeje
)
smithj:x:561:561:Joe Smith:/home/smithj:/bin/bash
^ esa X es la de la que hablás
Y una muestra del /etc/shadow:
smithj:Ep6mckrOLChF.:10063:0:99999:7:::
Donde "Ep6mckrOLChF." es la contraseña cifrada. Es eso lo que hay que borrar.
Saludos.