Según leí el aumento de tamaño con la codificación no puede evitarse, en mi caso tuve que exponérselo al usuario y decirle que debe subir archivos con un 33% menos que 2,5M que era el tope sin codificar.
Dejo el enlace donde aclara el aumento de peso, por si alguien lo necesita.
http://support.microsoft.com/kb/323489/es
De todos modos si alguien conoce otra solución que avise.