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Iniciado por RootK 
Si estás hablando de aplicacion web desarrollada con 2005 ya verificaste que en tu IIS en el tab asp.net tengas configurado tu site para framework 2.0 ?? y que las librerías que corres del pdf estén compiladas para 2.0??
Salu2
los metodos cambian, además en la version debes usar IIS, pero en las 2005 puedes usar IIS o un servidor en localhost por un puerto al azar. Las versiones no son compatibles, hay mejoras en la 2005, como por ejemplo el gridview a su antecesor el datagrid. Ya eso solamente cambia el bin.
Salu2