Squid

[AleSanchez]

A ver, tenes los conceptos mal estudiados.

Un Proxy Squid no sirve para POP3, no es que haya "problemas", sino que no fue diseñado para eso.

Lo que vas a tener que hacer es usar tu equipo como router, e instalar el Squid para las funciones de proxy. Para que tus clientes no salteen el proxy, vas a tener que configurar correctamente iptables para cerrar toda comunicacion con el exterior y dejar por ejemplo pop3 que es lo que necesitas.

Antes de que me preguntes "¿Como hago eso que me decis?" investiga estos temas (Casi todos creo que fueron hablados en el foro, usa el buscador)

Iptables para implementar un router, NAT
Squid, instalacion y configuracion

Y con respecto a tu pregunta final, te adelanto que eth0 no deberia tener una IP de LAN, solo deberia ser el bridge (puente) para el PPPoE (o lo que uses, deduzco que es ADSL) y el firewall lo configuras con la interface ppp0 como WAN, y la eth1 como LAN.

Saludos.