Tienes que comunicar Java con JavaScript (no con el HTML directamente ya que este no es un lenguaje de programacion).
Puedes probar como explica aqui:
http://java.sun.com/j2se/1.5.0/docs/...e/js_java.html
o buscar "javascript applet communication" y revisar documentacion. Algunas de las opciones son antiguas, ojo, ya que el tema ha cambiado segun avanzaba y cambiaba el plugin de Java.
S