Al momento de configurar tu site en DW necesitas especificar la información del FTP de tu servidor. si ya configuraste el site puedes ir a: Site -> Manage Sites. En la ventana que sale escoges tu site y le das a 'Edit' o Cambiar (yo lo tengo en ingles). Cuando sale la ventana para configurar el site escoges la pestaña de 'Advanced' y luego en el menú de la izquierda escoges 'Remote Information'. En el menú desplegable que esta donde dice Access escoges 'FTP', entonces te saldrán los encasillados donde deberás poner tu información de FTP.
Una vez hecho, si quieres subir algo a tu servidor, sólo tienes que escoger el archivo y darle al botón que tiene una flecha mirando hacia arriba:
