Gracias por sus respuestas.
la aplicacion que tengo que hacer es una web application struts con WebSphere en eso no hay problema jeje, la cuestion es que no tengo nociones de coneccion con puerto serial y si ya vi algunos post y tambien comprobe como dices GreenEyed que no hay api para windows pero no importa por que es para linux
, si por algun lado hay alguien que sepa como hacer esto pues les agradeceria mucho como dato adicional tengo que conectar un bascula al PC