Bueno pues definitivamente el problema no es del navegador. Ya se donde está el fallo pero no se como solucionarlo. Yo tengo puesto el siguiente codigo:
<? echo "<a href=borrar.php?id=$MostrarFila[0] onclick='return confirm(seguro que desea cancelar)><img src='Imagenes/eliminar.png' alt='Eliminar Contrato' border=0/></a>" ?>
Obligatoriamente tiene que estra así y de esta forma no me reconoce el onclic, alguna sugerencia para solucionarlo?? Gracias