Hola joja_2 mira actualmente yo tengo configurado dos servidores web, uno es IIS y el otro es apache y asi como tu dices, uno lo tengo para una determinada aplicación y el otro con otro directorio y no me han dado problema alguno, lo que si es que al instalar el coldfusion especifica que ejecute el IIS y es todo sin problemas, crea un directorio virtual o sitio y listo
