Sería bueno si pudieras poner el código. Supungo que debes tener algo así.
window.onload=func1;
window.onload=func2;
window.onload=func3;
La llamada al evento onload es luego de que toda la página ha cargado, incluyendo esas tres asignaciones. Cada asignación sobrescribe a la anterior.
Para solucionarlo puedes hacer lo siguiente
Código HTML:
function miOnLoad(){
func1();
func2();
func3();
}