Es que las comillas están mal. Prueba con esto:
Código PHP:
var pop;
pop = window.open('admin.php?val1='+valor+'?val2='+nombre,'','height=400,width=600,top=10,left=50,location=no,menubar=no,scrollbars=no,resizable=no,status=no,titlebar=no,toolbar=no,directories=no');