ayuda con este programa porfavor

[Wyke]

buenas , tengo un problema , yo soy programador C , i estoy empezando a aprender java , pero necesito crear un miniprograma que decodifique contraseñas
en base 64 pero un poco modificable , lo bueno es que tengo el codigo fuente

del codificador i del decodificador , pero yo de java ando algo listo , estoy leiendo i tal pero me cuesta , pero poco a poco , i pongo aki para haber si alguien me podria ayudar

el codigo es el siguiente http://pastebin.com/m52d15402 , ese codigo es el del decodificador i codificador

lo que deseo es crear una mini aplicacion donde tu le des el el nombre codificado i te lo descodifique ,

mirando el codigo , llegue a la conclusion que el programa mas o menos seria esto

byte [] decodificado = Base64.decode("el texto que sea");

lo que no se como funciona es la manera de añadir la libreria ( abia pensando poner como libreria el decoder ) i como compilarlo todo . si me pueden ayudar , me harian un gran favor, mil gracias !