MySql -> FREE / Sqlserver -> CARO
MySql -> muy rápida / Sqlserver -> muy rápida/rápida
MySql -> no transacional / Sqlserver -> transacional
MySql -> no permite vistas / Sqlserver -> permite vistas
MySql -> no subselects / Sqlserver -> si subselects
Estas son de las más importantes, creo, pero seguro que falta alguna característica.
Si he metido la gamba en alguna cosa que alguien lo diga
que no estoy 100% seguro.