Si, puedes configurar un cronjob desde el CPanel.
O si tienes acceso a el servidor mediante SSH tambien.
Aunque por CPanel es mas facil :P
:P Yo no estaba deacuerdo con lo de crear el script con un while y sleep, solo señalaba las desventajas.
Si sabes ingles te dejo esta URL:
http://www.thesitewizard.com/general/set-cron-job.shtml