Lo primero cambia de nombre tu variable a algo como sInput (porque es un String)
El id del Input no estaria mal que lo renombrases tambien por si acaso
Y luego en el if ponle una condicion tal que asi:
Código:
var sInput = document.getElementById("boxInput").value + "algo";
if (sInput.value!="") //Para comprobar que no este vacio
{
.
.
.
}
else //si esta vacio
{
.
.
.
}
De todas maneras si le concatenas algo nunca va a estar vacio y siempre entraria al if de esta manera