Hola
No he visto tu página ya que en el trabajo tienen muchas páginas restringidas, pero bueno, el motivo de por que te hace eso está explicado en algún lugar del foro, que ahora no recuerdo bien (creo que es en css o html).
Internet Explorer añade un margen, para que no te haga esto dentro de la página donde tienes el código CSS o dentro de los style en el HTML, no se cual sea tu caso agrega:
*{ margin: 0px; padding: 0px; outline: 0}
Con eso se soluciona.
Espero haberte ayudado
