Si lo que quieres es ejecutar codigo de una app diferente a la tuya no te recomendarias ninguna version de visual basic sino mas bien c++ o algun lenguaje de bajo nivel.
Pero si lo que quieres es hacer click a un boton cualquiera de una ventana cualquiera de una app cualquiera puedes usar algunas APIs de windows, lo primero que tendrias que haces es objener el ID unico de la ventana (Handle) luego con ese id de la ventana obtener el ID unico del boton al que quieres hacer click y con ese id mandarle un evento click:
haber si te ayuda este hilo:
http://www.forosdelweb.com/f69/click...ico-vb-483975/