El problema es que no podés mezclar PHP y Javascript de esa forma, tené en cuenta que PHP se ejecuta en el servidor, antes de que éste envíe la página al navegador, y Javascript se ejecuta en el navegador, luego de que la conexión con el servidor se cerró.
Te recomiendo revisar las preguntas frecuentes del
foro de Javascript, donde podrás encontrar ejemplos de cosas similares a lo que querés hacer, y leer la página del manual de PHP relacionada con la
recepción de datos de un formulario.
Saludos.