Corrección en negrita:
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<title>Visualización de Funcionarios</title>
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<base target="abajo">
<FORM ACTION="prueba2.php" METHOD="POST" target="abajo">
<hr size="3" width="100%" color="#000000">
<b>Seleccione una Entidad</b>
<select name="Sucursal" value="$Sucursal">
<option > </option>
<option >Campo 1 </option>
<option >Campo 2 </option>
<option >Campo 3 </option>
</select>
<INPUT TYPE="Submit" VALUE="Aceptar" >
</FORM>
<table summary="" width="674">
<tr>
<td width="666">
<input type="button" value="A" onclick="
parent.abajo.location.href='prueba4.php?inicial=A'">
<input type="button" value="B" onclick='
parent.abajo.location.href="prueba4.php?inicial=B"'>
<input type="button" value="C" onclick='
parent.abajo.location.href="prueba4.php?inicial=C"'>
<input type="button" value="Z" onclick='
parent.abajo.location.href="prueba4.php?inicial=Z"'>
</td>
</tr>
</table>
<table border="0" width="100%">
<tr>
<td width="30%">
<FORM ACTION="prueba5.php" METHOD="POST">
<input type="text" NAME="uno" size="6" maxlength="6">
<input type="Submit" value="Buscar Nro" >
</FORM>
</td>
<td width="70%">
<FORM ACTION="prueba4.php" METHOD="POST">
<input type="text" NAME="inicial" size="20" maxlength="20">
<input type="Submit" value="Buscar AyN" >
</FORM>
</td>
</tr>
</table>
<hr size="3" width="100%" color="#000000">
</html>