Tampoco era necesario crear las particiones lógicas, ya que el asistente de instalación de cualquier distro es perfectamente capaz de coger el espacio libre disponible y crear particiones nuevas en él. El problema era que tenías que dejarle "campo libre" eliminando de la ecuación una partición primaria. Pero si ya tienes hechas las particiones, pues perfecto.
Antes de instalar, acuérdate de hacer copia de respaldo de todo.
