Ya encontré el problema xP
Estoy usando EasyPHP y FCKeditor trabaja desde la raíz del sitio, ahí descomprimí FCKeditor y copie esa misma carpeta al directorio donde se encuentra mi proyecto, edite solo el archivo fckconfig.js que se encontraba en el directorio de mi proyecto, entonces funcionaba porque yo llamaba al archivo de configuración que se encontraba en la raíz del sitio, pero parecía que no ocurría nada al editar el archivo de configuración en la carpeta de mi proyecto; porque, ese archivo no era el que se estaba llamando, sino el de la raíz del sitio.
Ya he eliminado la información que se encontraba en la raíz "localhost" y la he sustituido por la que se encontraba en el directorio de mi proyecto, limpie el cache de nuevo y la configuración de mi barra de herramientas se cargo correctamente.
