ayuda para orientacion para hacer calculo de vacaciones

[doylelives]

En realidad eso es tarea para un contador. Una vez que tengas los requisitos y operaciones necesarias para calcular pagos, dias etc podrás volcarlo en codigo php.
Sino eres contador te recomiendo realizarlo en papel y cuando te funcione hazlo en php.
A simple vista si es más que recomendable crear una tabla vacaciones. Para trabajar todo el modulo que corresponde a las vacaciones dentro de esta tabla.
El nombre y la cantidad de campos de la tabla dependera de lo que te dije al principio.