Hola tepitenio, comparto lo que dices que a veces los trackbacks mezclados con los comments se vuelven visualmente incómodos, es por eso que algunas webs deciden separarlos
Sobre lo que comentas sobre si es "peor o mejor" no lo se, socialmente es mejor ya que un enlace de vuelta es una forma de agradecer, de cara a la usabilidad y/o
experiencia de usuario es útil también, ya que te permite, luego de leer una nota o un artículo, ver dónde comentaron sobre esa nota y leer otras opiniones o puntos de vista al respecto.
Aunque como tu puntualizas, quizá desde el punto de vista estrictamente de optimización para buscadores, no sea la
mejor mejor opción
;) ¿Que opinan los demás?
Saludos