Hola:
log4j es java y está disponible para todos los sistemas operativos (puesto que es java). Permite mucha más configuración que el logging por defecto de java, pero no te va a permitir poner los log de las clases en colores. Ten en cuenta que un fichero de texto plano no tiene colores.
Como opciones, con log4j puedes simplemente indicándolo en el fichero de configuración, hacer que cada clase saque el log en ficheros separados e incluso con formatos distintos.
Usando el "truco" de formato distinto, podrías poner en el fichero de log secuencias de
códigos ansi, con lo cual, en el fichero de log tendrías algunos caracteres extraños. Sin embargo, si la ventana donde muestras el log con un type o cat soporta los caracteres ansi, sí podrás ver el log de cada clase de un color distinto.
Se bueno.